以東京為中心發生六件大範圍的連續殺人事件，引起警政高層的重視，柯南意外地發現「黑色組織」涉及整個事件! 如果他們知道工藤新一還活著的話，那麼新一與柯南的夥伴們會不會一併遭到追殺?! 知道事態危險的柯南又如何獨自展開搜查.. 主題曲:倉木麻衣 「PUZZLE 」