以不良少年著稱的《馬鹿田男子高校》和品學兼優《洋蘭貴族女子學院》合併後誕生的《第二洋蘭學院》，通稱為《馬鹿蘭高校》。一開始處於對立關係的兩校學生，在攜手克服許多難關與化解廢校危機之後，終於成為好朋友，校園的太平盛世終於到來。教室內男女生之間淡淡的曖昧情愫，在原本馬鹿田高校的勇氣（傑西 飾）和誠（高地優吾 飾）的眼裡看來，是男校軟弱的表現，因此向老大達也（慎太郎 飾）宣戰“我們再也不要服從你了！”原本團結的馬鹿田內部爆發嚴重分裂。

就在這個當下，新的衝擊到來。在學校校舍改建的一個月之間，馬鹿蘭的學生被告知要去《第一洋蘭高校》寄讀。如果不能乖乖遵守那裡比馬鹿蘭高校更嚴格的校規，就會受到停學或退學的處分。達也這群人根本懶得管這些，可是他們被文惠（島崎遙香 飾）說服，答應好好遵守校規，相約一個月後一起回到馬鹿蘭高校。原以為煎熬無比的一個月，卻是某人的甜蜜時刻，那就是最花癡的祥平（高木雄也 飾），他對保健室的水原老師（小嶋陽菜 飾）一見鍾情；同時馬鹿蘭的古葉老師（宮田俊哉 飾）也對水原老師展開熱烈追求。性感保健室老師引發的師生三角戀會如何發展下去呢？

此時，視馬鹿田高校為勁敵的菊永高校出現不尋常的動作。一切源自過往，達也的哥哥、馬鹿田畢業生的蓮（內博貴 飾）和菊永畢業生的健治（玉森裕太 飾）曾經結下樑子。連續劇未曾交代的蓮的過往，將在電影版中水落石出。另一邊，文惠也遇上難題。受到校內女學生崇拜的文惠，在第一洋蘭學院學生會長結花（加藤玲奈 飾）的眼裡簡直是眼中釘。她燃起打敗文惠的意志，在校慶文化祭特意挑起競爭。殊不知文惠心中早有另一個煩惱。原來文惠計劃實現留學的夢想，正在考慮要不要報名去美國當交換學生，但是卻又對既熱血又傻瓜的達也那群傢伙放心不下。

各種問題陷入無解的狀態，文化祭照常舉行。脫離團體兩人行動的勇氣和誠被菊永高校的不良學生綁架，得知消息的達也會無視嚴格的校規，前往營救昔日的夥伴嗎？還是會信守和文惠立下的承諾呢？此外，達也、文惠和哲也（松村北斗 飾）之間微妙的三角關係會發展成如何意想不到的局面呢？