故事接續《蜘蛛人：離家日》片尾，描述號角日報對外公佈了蜘蛛人真實身份是彼得帕克後，警察指控他利用無人機殺害神秘法師，讓彼得帕克遭到輿論攻擊、而他與親友的生活也大受影響。為了改變現況，絕望的彼得帕克找上了「奇異博士」，希望他施展法術讓大家忘記他是蜘蛛人的事實。